一些重要場合使用的門禁系統還可能提出一些特殊功能要求，如防尾隨、防脅迫(脅迫報警)、反潛回、消防報警監控聯動、網絡設置管理監控、邏輯開門功能等功能。
防尾隨功能：就是持卡人必須關上剛進入的三輥閘閘門才能打開下一個門。本功能與反潛回實現的功能一樣，只是方式不同。
反潛回功能：就是持卡人必須依照預先設定好的路線進出，否則下一通道刷卡無效。本功能是防止持卡人尾隨別人進入。
消防報警監控聯動功能：在出現火警時三輥閘門禁系統可以自動打開所有電子鎖讓里面的人隨時逃生。與監控聯動通常是指監控系統自動將有人刷卡時(有效/無效)錄下當時的情況，同時也將門禁系統出現警報時的情況錄下來。
網絡設置管理監控功能：大多數門禁系統只能用一臺微機管理，而技術先進的系統則可以在網絡上任何一個授權的位置對整個系統進行設置監控查詢管理，也可以通過INTERNET網上進行異地設置管理監控查詢。
邏輯開門功能：簡單地說就是同一個門需要幾個人同時刷卡(或其它方式)才能打開電控門鎖。